Hauptberuflich koordinierte Dr. Jürg B. Altorfer die Veranlagungspraxis in den Bereichen Selbständigerwerbende und juristische Personen, Vermögensertrag und verbundene Aktionäre im Kantonalen Steueramt Zürich.

Daneben wirkt er seit langer Zeit als Präsident der Arbeitsgruppe Unternehmens-steuern der Schweizerischen Steuerkonferenz (SSK) auch national in der Gesetz-gebung und bei Praxisfestlegungen mit und übt für die Konferenz der kantonalen Finanzdirektorinnen und Finanzdirektoren (FDK) Mandate in Fragen der nationalen und internationalen Unternehmensbesteuerung aus. Schliesslich wirkt Dr. Jürg B. Altorfer als Präsident der Fachgruppe Qualitätssicherung in konzeptionellen Fragen und bei der Gestaltung und Umsetzung des Datenmanagements bei der Neu-gestaltung des Finanzausgleichs und der Aufgabenverteilung zwischen Bund und Kantonen (NFA) mit.
Dr. Jürg B. Altorfer bestreitet als Dozent Seminare, Aus- und Weiterbildungs-veranstaltungen am Institut für Schweizerisches und Internationales Steuerrecht (ISIS), wo er auch Mitglied der Institutsleitung ist, am Schweizerischen Institut für Steuerlehre (SIST), bei der International Fiscal Association (IFA), bei der Schweizerischen Steuerkonferenz (SSK) sowie bei den Lehrgängen zum diplomierten Steuerexperten (EXPERTsuisse) und der Universität Zürich für den LL.M. International Tax Law. Bis Ende 2008 präsidierte er die Klausurkommission für die Steuerexpertenprüfung.